Resumen: La investigación sobre los genes espaciales, al revelar las características de la forma espacial y sus leyes de evolución, desempeña un papel clave en la articulación mutuamente beneficiosa entre la protección del entorno natural, la transmisión histórico-cultural y el desarrollo constructivo contemporáneo. Sin embargo, ante la ausencia de una ruta sistemática y estable de identificación y extracción, la investigación tiende a incurrir en problemas de indefinición, incompletitud e inadecuación en la identificación de los genes espaciales. A partir del contenido conceptual y del mecanismo de acción del gen espacial, este artículo sostiene que el núcleo de su identificación y extracción consiste en aclarar el patrón de interacción «espacio-naturaleza-cultura» contenido en determinadas características espaciales. Este proceso puede desarrollarse mediante cinco pasos: inventariar los espacios característicos; obtener la percepción pública de dichos espacios; agrupar y cribar los rasgos de cognición espacial; extraer las relaciones configuracionales de los elementos espaciales; y combinar un conjunto de reglas de organización espacial. Una identificación y extracción precisas determinarán directamente la eficiencia operativa y la exactitud de las tecnologías de análisis y transmisión de genes espaciales en la práctica, y constituyen un componente importante del diseño y la planificación territorial orientados al desarrollo sostenible.